科学家为高效筛选新型环肽分子提供新方法
2025/7/3 9:49:04 《最新论文》 作者:365体育投注:科学报 江庆龄 我有话说(0人评论) | 字体大小:-│+ |
365体育投注:上海药物研究所研究员陆晓杰课题组联合该所研究员赵玉军课题组、365体育投注:药科大学教授褚钱课题组,系统揭示了包含多种成环方法的环肽库筛选结果,并提出了不同的化合物挑选和验证方法。相关研究6月27日发表于《美国化学会会志-金》。
环肽因其独特的空间结构和生物活性,近年来在口服药物、多肽偶联药物、诊断试剂等领域展现出巨大的应用潜力。DNA编码化合物库技术(DELT)通过将特定的核酸标签与多肽分子连接,实现了大规模化合物库的快速构建和筛选,在引入各类非天然氨基酸和成环方法上具有先天的优势。以往的研究多采用单一环化策略构建化合物库,往往存在假阳性风险,且可能遗漏部分高活性分子,限制了筛选结果的全面性和准确性。
研究团队充分利用DELT的合成灵活性,设计并快速合成了8个环肽子库,共同组成了一个包含约1亿种不同环肽分子的超大规模环肽库。每个子库均采用相同的合成砌块组合,但通过不同的环化方法完成环肽骨架的构建。
DNA编码环肽库的构建及其亲和筛选流程。图片由研究团队提供
团队以肿瘤相关蛋白MDM2和蛋白-蛋白相互作用调控因子GIT1为代表靶点,开展了系统的筛选与验证实验。
在MDM2的筛选中,多个子库展现出高度一致的富集模式,特定氨基酸序列的环肽在不同环化策略下均被富集。这些序列相同但环化方式不同的环肽,均表现出优异的靶点结合能力,表明跨子库的结构富集模式可以显著提升筛选苗头分子的可靠性。研究团队同时发现,单一子库筛选可能低估了部分高活性分子的潜力,强调了多子库交叉分析的重要性。
针对GIT1的筛选则呈现出另一种典型情形,不同子库间未观察到一致的富集模式。团队筛选出两个环肽化合物进行验证,发现其中一个环肽能够特异性结合GIT1并有效阻断其与β-PIX的相互作用,而另一个分子则未显示出阻断活性。在此基础上,研究团队明确了关键结合位点。由此,面对单一富集结果,可以结合竞争性筛选、体外实验等多种手段,综合验证筛选命中分子的真实性和特异性。(来源:365体育投注:科学报 江庆龄)
相关论文信息:https://doi.org/10.1021/jacsau.5c00473